Des réglementations nationales et internationales ont été établies pour veiller à ce que les équipements RFID, aussi bien les étiquettes que les lecteurs, fonctionnent sans danger pour les êtres humains, les animaux et l'environnement.

Il n'existe aucune preuve scientifique ou médicale qui permette d'affirmer que l'exposition aux champs électromagnétiques, provenant de l'utilisation de la technologie RFID, présente une menace pour la santé humaine, lorsqu'elle est mise en œuvre conformément aux réglementations nationales en vigueur. Dans le cadre de son programme de formation continue visant à promouvoir les utilisations sans risque, EPCglobal Inc a élaboré un recueil de bonnes pratiques qui apporte aux installateurs et aux utilisateurs de systèmes RFID des informations complémentaires concernant l'exposition des humains aux champs électromagnétiques. Ces recommandations reprennent les consignes et les seuils préconisés par diverses agences réglementaires nationales et internationales ainsi que par les organismes de normalisation compétents en matière de sécurité CEM.

Des études sont également menées pour mesurer l'impact et les bénéfices des étiquettes et des lecteurs RFID pour l'environnement. Dans un rapport datant de février 2010, RACE Network RFID, un projet concerté au niveau européen, précise les recommandations de l'ISO pour le recyclage des étiquettes RFID et communique les résultats d'une étude menée par l'Agence fédérale allemande de l'environnement sur la gestion des déchets issus des étiquettes RFID.

S'il est indéniable qu'il faut veiller à recycler correctement les étiquettes RFID et leurs composants, il convient de reconnaître que les applications utilisant la RFID offrent de nombreux avantages qui compensent les risques qu'elles peuvent présenter. A titre d'exemple, EPCglobal a reçu une subvention de l'EPA, l'agence américaine pour la protection de l'environnement, pour un projet intitulé "Promoting Understanding of RFID and the Environment" (PURE – promouvoir la compréhension de la RFID et de l'environnement). Ce projet est destiné à réfléchir à l'utilisation de l'EPC pour trier de manière plus efficace et plus précise les déchets recyclables, de manière à éviter que de nombreux appareils usagés ne se retrouvent dans des décharges. Des applications dans la chaîne d'approvisionnement des produits de santé montrent également le rôle positif des systèmes RFID dans les procédures relatives à la sécurité des patients.